Urządzanie akwarium od nowa w czasie jego działania

Posiadam akwarium 180 litrów, które działa już mniej więcej od pół roku. Chciałbym teraz całkowicie zmienić aranżację. Oznacza to wymianę większości dna, żwirku, roślin, itp. Zamierzam zostawić około 100 litrów wody w wiadrach z obecnego akwarium do napełnienia zbiornika po urządzeniu go na nowo, resztę uzupełnię wodą z kranu. Prawdopodobnie stracę wiele bakterii, ponieważ będę wyjmować praktycznie całe podłoże i żwir, oraz filtr pozostanie wyłączony przez około 3 godziny. Chciałbym to jakoś przynajmniej po części zrekompensować wlewając starą wodę, ponieważ muszę wpuścić rybki do zbiornika od razu po zakończeniu prac. Czy masz może jakiś pomysł jak lepiej przeprowadzić podobną operację? Podczas prac przy nowej aranżacji zamierzam trzymać rybki w dużych wiadrach. Filtr wewnętrzny jest na stałe zamontowany w akwarium,  nie mogę zachować jego pracy, np. we wiaderku z wodą.